La ville des ombres est composée de deux parties. Le jeu commence dans la ville basse.
Vous pouvez aller dans la ville haute après avoir terminé l'enquête « Invités inattendus » ou durant des événements qui se déroulent dans des lieux de la ville haute.
Chaque partie de la ville possède sa propre carte, ses lieux, quêtes, collections et assembleurs.
Pour passer d'une carte à l'autre, ils vous suffit d'appuyer sur le bouton du dirigeable dans le menu du bas.