A Cidade das Sombras consiste de duas áreas.
O jogo começa na Cidade Baixa.
É possível ir para a Cidade Alta após concluir a investigação Visitantes inesperados ou participando de eventos que ocorrem em locais da Cidade Alta.
Cada parte da Cidade tem seu próprio mapa, locais, casos, missões, coleções e condutores.
Para alternar entre as áreas da Cidade, pressione o botão do zepelim no Menu inferior.